康熙帝玄燁是清朝歷史上極其杰出的帝王，而其祖母孝莊太皇太后，是清朝最杰出的后妃，兩人乃是親祖孫，相當親厚，但在削藩問題上，二者意見不同。
玄燁血氣方剛，認為時不我待，必須要及時撤掉三藩；而孝莊太后老成持重，則主張以靜制動等吳三桂自己老死，讓時間解決所有問題，至少不急于一時，畢竟當時清朝的實力與三藩也不過伯仲之間，沒有絕對的優勢，強行撤藩實在太冒險。但最終，向來孝順祖母的玄燁卻并沒有聽話，而是在康熙12年正式撤藩。
其實，孝莊主張靜待時機并非沒有道理：
首先，吳三桂當時的實力不可小覷
吳三桂出身武將世家，其父親乃明朝錦州總兵吳襄，舅舅是名將祖大壽，自由習武善于騎射，不到二十歲就考中武舉人，27歲成為明朝寧遠團練總兵。
雖然后世對于吳三桂的評價多持負面，認為其打開山海關放滿洲進入中原，離叛明王朝，勒死永歷帝，但這是品德方面的問題，而能力方面，吳三桂的能力是相當強悍的，在清朝建立之后的初期，吳三桂南征北戰，為清朝的穩定立下汗馬功勞。
而對于這些，孝莊太后都是看在眼里的，她知道吳三桂的實力到底有多么強悍，并非是輕易能夠對付的人，冒然撤藩引起吳三桂反叛，是極其危險的。
再者，皇孫玄燁實在太年輕
康熙帝正式決定撤藩的時候，其實也才20歲，這樣的年紀雖然在古代也是個成人了，何況康熙帝14歲就做了父親，但是在朝堂之上，玄燁還是個新手，他年少登基，大事小情都由孝莊太后與鰲拜、索尼等人打理，撤藩前后距離他親征也沒多久，而他的對手是老謀深算的平西王吳三桂，相差懸殊。
孝莊疼愛孫子，她知道玄燁的能力突出，但朝堂與沙場之上，靠的不僅是才華能力，經驗也是非常重要的因素，比之于吳三桂，孝莊太后覺得自己的皇孫實在是太嫩了。
順治帝英年早逝，駕崩很早，而玄燁繼位之時非常年幼，主要事務都由其祖母孝莊太后主持，玄燁也是孝莊太后一手帶大，祖孫之間的感情非常深厚，以至于孝莊太后離世，康熙帝將其靈柩停在慈寧宮許久不愿挪宮，結果后來的清朝太后都不敢住。
不過在撤藩的問題上，祖孫倆意見不一致，而最終玄燁還是沒有聽從祖母的意見，而是按照自己的意思來，直接宣布撤藩，做好了與吳三桂等人硬碰硬的準備。
康熙帝玄燁如此強勢，也有一定因由：
第一，玄燁年輕氣盛
所謂初生牛犢不怕虎，玄燁雖然年輕，但是其16歲的時候就憑借一己之力，直接鏟除了權臣鰲拜，將朝權悉數收回，而平定三藩的時候，玄燁也才20歲。
說句有些過的話，那就是無知者無畏，玄燁對于三藩的勢力到底有多大，其實也必然進行過深入的了解，但其年輕，終究是閱歷尚淺，所以也沒有像孝莊太后那般顧慮很多，正因如此才不知道怕，只知向前猛沖，有些事情，屬于后怕。
第二，三藩問題愈發凸顯
三藩勢力過頭，尾大不掉
平西王吳三桂、平南王尚可喜與靖南王耿精忠，這三人雄踞一方，原本在清朝初期也立下大功，可飛鳥盡良弓藏，清朝定鼎之后，這三藩就成為了一個很大的問題。
三藩在其所鎮守的地方上權勢極大，遠遠超過了朝廷委派的人員，直接掌握當地的軍隊與稅賦，形同諸侯，擁兵自重，三藩的勢力幾及全國之半。
花銷巨大，成為累贅
順治十七年，云南俸餉九百余萬，加粵閩兩地，一年需要兩千萬兩，如此，使得從當時開始三藩每年就要耗掉朝廷稅賦的近乎一半。
三藩通過巨額的財富，逐漸武裝到了牙齒，而三王本身，也建造華美的王府，與蒙古西藏等地購買大量的馬匹、鐵器等等，實際上已經成為了類似于唐朝后期的地方藩鎮。
第三，攘外必先安內
除了三藩的問題，當時的清王朝其實還有很多的其他問題，于內，三藩的問題尚且還沒解決的情況下，還有諸多其他的反清復明的力量不斷加強匯聚。
于外，蒙古的噶爾丹虎視眈眈，東南沿海的鄭氏也一直在籌謀如何反攻，可以說，康熙前期的清朝是麻煩事一堆，這種情況下，單個解決雖然冒險也非常困難，但總比所有問題一起發生，最后顧頭不顧尾要好得多。
其實，孝莊太后也知道，就算等到吳三桂老死，但他還有子孫后嗣，三藩的問題終究還是不會隨著吳三桂的死而真正消失，她主張等待，其實也只是無奈之舉，畢竟這是一場押上了清朝存亡的行動，一旦失敗，后果就難以預料。
孝莊太后雖然輔佐三朝，順治與康熙兩帝年幼時期，孝莊太后的影響力巨大，但其與史上其他聽政的太后并不一樣，她始終都沒正式臨朝垂簾，她更多的是輔佐與提意見，最終的決斷還是看皇帝自己的意思。
而康熙帝玄燁其實也冥冥之中覺得撤藩有些危險，但當時箭在弦上已不得不發，與祖母商定之下，決定冊立出生沒多久的胤礽為儲君，以防萬一。