因為這起案件的幕后牽扯極為復雜。
一，案件背景
太平天國期間，清政府為了平叛，將相當多的中央權力下方給了地方。此舉固然加快了平定太平天國的進程，但負面影響也是極大的，那就是導致以湘軍為代表的地方軍頭在各地勢力膨脹發展。
當時全國一共16個巡撫，其中湘軍和淮軍出身的巡撫就占了11個。他們的存在，很顯然已經嚴重威脅到了中央朝廷的權威。
所以到了同治七年，朝廷便下旨，將曾國藩調離兩江，改派馬新貽擔任兩江總督。
馬新貽非湘軍出身，他與其他地方派系也素無瓜葛。慈禧調他接替曾國藩。目的再明顯不過了，就是派他到江南“干臟活”，削弱湘軍在江南的影響力。
馬新貽上任兩江后，秉承慈禧的密旨，一面裁撤湘軍，一面打壓湘軍的散兵游勇。慈禧對其很滿意。
但他這么干的結果也是顯而易見的，湘軍上下對他恨之入骨。想殺他的人，不計其數。
同治九年的一天，馬新貽去兩江總督衙門西側的箭道場校閱士兵操練。檢閱結束后，一個叫張汶祥的人，突然從暗處殺出，一刀捅死了馬新貽。
這起事件，就是與“楊乃武與小白菜案”同為晚清四大奇案之一的“刺馬案”。
聽說馬新貽被殺，慈禧震怒了。堂堂朝廷從一品大員當街被人刺死。這世道到底還沒有王法了？必須得徹查，揪出幕后黑手。
于是慈禧下令，令滿洲鑲紅旗出身的江寧將軍魁玉徹查此案，嚴審張汶祥，搞清楚誰在他幕后主使。
可是，調查的結果卻讓慈禧叫苦不迭，仿佛捅了馬蜂窩似的。因為查來查去，最終的黑手都指向了湘軍。可魁玉又拿不出是湘軍的人在幕后操控的鐵證。
沒證據，不能服眾。如果處理不好，湘軍是會造反的！無奈之下，慈禧只好把曾國藩又調回江南，讓他徹查這起案件。
曾國藩到任后，稀里糊涂的就結了案，沒追究任何人，也沒有把事情鬧大。他的舉動仿佛就好像是說，馬新貽被殺了？死了就死了吧。權當這世上就他沒這號人存在過。
堂堂兩江總督被殺，就這么結案。慈禧當然不能接受，但她心里也清楚。這個事，只能是揣著明白裝糊涂。你不說，我也不說，就此打住算了。誰也不準再提了！
至于裁撤湘軍，也是就此打住，誰也不準再提這件事了。
不過，湘軍勢力強大，是事實。慈禧對此寢食難安。所以“刺馬案”的草草結案，也為多年后的“楊乃武與小白菜案”，慈禧借干涉案件審理之機，報復湘軍，埋下了伏筆。
二，案件起因
同治十二年十月的某一天，浙江余杭縣一名叫葛品連的短工突然發燒，他在連吃了兩天的藥后，病情急轉惡化，一命嗚呼。
事后，由于葛品連的口鼻內有血水流出，葛的義母馮許氏認為干兒子死的可疑，便勸說葛的生母到縣衙告狀。
當時，負責調查這個案子的余杭知縣劉錫彤是個典型的糊涂官，他在沒有確切證據，只聽別人傳言葛品連的妻子小白菜貌似與楊乃武有奸情，是兩人用砒霜毒死葛品連的情況下，就草草的將這起案件定義為奸夫淫婦謀殺相公。然后就把小白菜逮捕了。
在審小白菜時，劉錫彤問她毒死葛品連的砒霜是從何而來？小白菜平白無故被冤枉，根本不知道砒霜的事，自然只能說不知道。劉錫彤還以為小白菜是嘴硬，就嚴刑逼供。小白菜受不了酷刑，最后只好屈打成招，承認葛品連是被她用砒霜毒死的，自己與楊乃武有奸情，而砒霜就是楊乃武給她的。
劉錫彤認為案件有突破，便派人立即傳訊楊乃武，打算把他也拷打一頓。但楊乃武有確切證據，能證明自己與此事無關，而且他還有舉人功名，見了縣太爺可以不跪，也不得受刑，在公堂上，他和劉錫彤是平等的。
于是，劉錫彤就只好將此事上呈給了頂頭上司杭州知府陳魯。請陳魯向朝廷上折子，先革除楊乃武的舉人身份。再來審他。
陳魯是湘軍出身，上頭有關系。所以折子遞上去不久后，朝廷的文書下來了，楊乃武的舉人身份被革除。
革了楊乃武功名，不再有顧忌的劉錫彤馬上對楊乃武也是大刑伺候，各種刑具對楊乃武是輪番上陣。楊乃武被打得皮開肉綻，最后只好認罪，也承認自己和小白菜有奸情，說毒死葛品連的砒霜是自己在余杭縣附近的藥店買來的。
劉錫彤拿到供詞，很高興。親自到楊乃武所說的藥店取證。面對劉錫彤的追問，藥店老板起先是矢口否認，說沒這回事。但老板架不住劉錫彤的威脅，便也只好昧著良心說確有其事。
人證、物證也有了，口供也對上號了，這下可以結案了。
同治十二年十一月初六，杭州知府陳魯判決楊乃武斬立決，小白菜凌遲處死。
不過，清朝法律規定，地方官不能隨便處決死刑犯。死罪要有上級批示才能執行。而所謂的上級，就是浙江按察使、浙江巡撫以及京城刑部官員的審批。
當時的浙江按察使叫蒯賀蓀，浙江巡撫叫楊昌浚。這兩位，楊昌浚是湘軍出身，蒯賀蓀不是湘軍出身，但也是憑軍功上位，早年與湘軍有交往。所以他們接到案子后，均是偏袒草草結案的劉錫彤和陳魯，將案件審理結果上報給了刑部復核。
如果一旦刑部的批示下來了，是準奏。那么被冤枉的小白菜就得被千刀萬剮，楊乃武就得人頭落地。這起案件，就得是以兩人被冤殺而結案。
三，上訴與復審
楊乃武與小白菜的案子報上去后，由于刑部官員一向辦事拖沓，沒有效率。所以終審批示便一直沒有下文。而正是由于這些官員們拖沓辦事的作風，竟然讓案件起了轉機。
因為就在這個期間，楊乃武在獄中給姐姐楊菊貞寫了一份申訴材料，請她幫自己到京城的都察院告狀。
同治十三年四月，楊菊貞變賣了家產，踏上了前往京城的艱辛路。
如果不是刑部官員的拖沓，給楊菊貞留出了足夠時間。可能她還沒到京城，楊乃武就已經被砍頭了。
楊菊貞到京城后，找到都察院。但都察院在接到了她的呈詞后，不想審理。只是讓她回去找浙江巡撫衙門，讓地方官重審此案。
得著都察院的回復，楊菊貞本來是滿懷希望的踏上歸程。但是，她的愿望很快就殘酷的現實給擊破了。因為浙江巡撫楊昌浚根本就沒有心思親審這個案子，他把此事直接甩給了杭州知府陳魯復審。
而讓陳魯復審，結果還用猜嗎？冤案就是他一手造成的，他當然是維持原判了。
得到這個結果，楊菊貞要崩潰了。第一次進京告狀，已經花光了她的家底，此時，她已經沒有能力再上京告狀了。面對即將被斬首的楊乃武，楊菊貞只能是哭訴，乞求貴人相助，救救自己的弟弟。
還別說，此時的楊菊貞還真就碰上了貴人。
誰呢？胡雪巖。
胡雪巖當時就在杭州，他有個幕僚是楊乃武的好朋友，這位好友知道楊乃武的事后，就把來龍去脈告訴了胡雪巖。并請胡雪巖幫幫忙。胡聽說后，當即找來楊菊貞，表示將全力支持她上京打官司。
當年九月，楊菊貞和楊乃武的妻子詹彩鳳一起進京告狀。臨行之前，浙江籍京官、翰林院編修夏同善恰好也要從杭州返京。胡雪巖借機便宴請夏同善，請他回京后，幫助楊菊貞從中周旋。
夏同善聽說這是個冤案，很樂意幫忙。便在返京不久后，親自帶著楊菊貞和詹彩鳳，以及楊乃武親手撰寫的血書，到步軍統領衙門遞交了訴狀。
這一次，由于有朝廷官員的幫忙，所以楊菊貞的狀紙，沒有再像上次那樣，打給地方官員處理，而是往上遞，直接就送達到了同治皇帝的老師，時任軍機大臣翁同龢的案前。
翁同龢一向以清流自居，像這種草菅人命的案子，他當然是要管到底的。所以，他在詳細看過訴狀后，直接把案子交給同治皇帝御批。最后，楊乃武與小白菜的案子是以同治皇帝朱筆御批，要求地方再審的形式，又二度打回到了浙江巡撫楊昌浚的手上。
按照常規理解。前番都察院打回重審，楊昌浚置之不理。可能是都察院分量不夠。現在皇帝親自要求重審，楊大人應該會對案子有所重視了吧？
如果你是這么想的話，那就太小看他了。
圖｜楊昌浚
四，民怨沸騰
之前，堂堂兩江總督馬新貽被殺，湘軍從上到下不帶怕的。而今的楊乃武，只是區區一舉人爾。至于小白菜，更只是一平民。楊昌浚怎么可能會認慫呢？
所以，盡管有同治皇帝的御批，楊昌浚最終還是把案子給壓了下了。在他看來，重審是不可能的。既然湘軍同袍判了楊乃武和小白菜的死罪。那這個事，即便是錯了，也得將錯就錯。
不久后，二次復審的報告打到京城。一大票京官都憤怒了。無法無天啊！其中，刑部給事中王書瑞上奏彈劾楊昌浚以及相關官員瀆職，并請光緒帝（二度復審期間，同治皇帝病死，光緒皇帝繼位）另派官員查辦此案。
光緒帝準奏，遣浙江學政胡瑞瀾復審。
這個胡瑞瀾不是湘軍出身，但他跟余杭知縣劉錫彤一樣，是個糊涂官。他負責楊乃武案復審后，也跟楊昌浚一樣，懶得查。因為他認為如果此案被翻，自己必然會被湘軍上下敵視。他這個官，也沒法當了。
所以最后，他也學楊昌浚，上奏，說案子不存在冤情，楊乃武與小白菜都是罪該萬死。
當時，中國已經有報紙和媒體了。楊乃武和小白菜案件，不僅朝廷官員在注意，媒體記者們也在注意。比如當時的《申報》就鋪天蓋地的跟蹤視報道，在民間形成了一種同情楊乃武和小白菜，盼望朝廷能幫楊乃武和小白菜洗刷冤情的輿論。
尤其是胡瑞瀾被任命為欽差后，民間的這種盼望情緒，達到了頂點。
豈不料，胡瑞瀾竟然維持原判。這一下可算是捅了馬蜂窩，朝野嘩然，民眾紛紛把胡瑞瀾罵的要死。順帶著把京城官員祖宗八代也問候了一番。
冤案也不敢翻？這都是什么鳥官？
之后，刑部受到了輿論壓力，只得第三次將復審報告打回，要求第四次復審。
同時，浙江籍的京官也是群體出面，給楊乃武站臺，聲稱如果朝廷不給個合理解釋，浙江士子在這件事上，定要討個說法。
于是，輿論的天平開始倒轉。楊乃武一案也就朝著有利于楊乃武的方向轉變了。
但需要注意的是。當時的官場，只是呼吁給楊乃武被翻案，翻案對象不包括小白菜。至始至終，官場上都沒有人給小白菜喊冤，一個都沒有。大家都認為小白菜是淫婦，說她私生活糜爛，人盡可夫。當時只有民間人士支持她。可老百姓又沒有發言權。
五，派系斗爭
眼見一件小案子，越鬧越大。慈禧決定出面干預。她先是召見了翁同龢、夏同善，對他們面授機宜。讓他們直接把楊乃武押到京城來，楊乃武一案的具體審理也直接交給刑部負責，不讓浙江地方官員插手此事。
既然慈禧發了話，很自然的，各級官員也就不敢再打馬虎眼。辦案人員均抱著全力以赴的態度，調查取證，查找案件的漏洞。
經過這一番扒底褲的復查，所有的偽證全部被挖出。比如劉錫彤說楊乃武和小白菜用砒霜殺人，可是砒霜呢？根本沒有。還比如藥店老板被迫做偽證，也是很自然被順藤摸瓜查出。當時就連余杭縣的仵作在檢查葛品連尸體前，事先沒有用皂角水擦洗銀針的細節都被深挖出來了。（清朝的技術官員給他們一點壓力，還是能辦成事）
這些細節，別看不起眼。但都很關鍵。比如仵作驗尸前沒有用皂角水擦洗銀針，這容易導致誤判。而一旦證明是誤判，間接上又可以證明葛品連并非是被毒殺的，從而在根源上推翻楊乃武和小白菜的殺人嫌疑。
根據這些細節，刑部官員把葛品連的尸棺也提到京城，并在北京海會寺開棺，給早已死去三年多的葛品連驗尸。最終確認，葛品連是病死的，并不是什么砒霜中毒。
事情到這里，真相大白了。
按常理來說，下一步就該是放人、嚴懲瀆職官員了吧？
可實際上，沒有那么簡單。因為按照清朝的律例，如果楊乃武被平反，那么楊昌浚和劉錫彤等人，就要被追究錯判的責任。
朝廷的官員在這個問題上，分成了針鋒相對的兩派。
一派是以翁同龢為代表，力主為楊乃武平反昭雪，并且懲辦冤案制造者；
另一派則是以四川總督丁寶楨為代表，極力反對為楊乃武平反。他的理由很簡單，如果這個鐵案要翻，將來就沒人敢做官了。
由于兩派相持不下，刑部的結案奏疏，又拖了兩個多月，遲遲不能上交。一直到光緒三年二月，刑部才向兩宮太后上奏了案子會審的結果。
結果是：推翻原審判決，并建議處分所有錯判的相關官員。
為什么數月后，刑部突然就敢上奏了呢？
因為慈禧對這件事，表明了自己的立場。
六，慈禧的介入
對于楊乃武案，慈禧起先也不想把事情鬧得太大，畢竟浙江官員上下加起來，有一百多人牽涉其中。如果她嚴查，那結果就真像丁寶禎說的那樣了，浙江沒官了。
可是，下面的人欺上瞞下，她也不能忍。早先馬新貽之死，她還記得呢。
所以，當一個叫王昕御史在翁同龢的暗中授意下，上了一疏后，慈禧被激怒了，她也下定了決心，清洗浙江官場，給地方軍頭一個教訓！
那么，王昕在奏疏中到底說了什么呢？這道奏疏的大意是這樣的：皇上再三下旨，要求詳審楊乃武案，然而楊昌浚，胡瑞瀾卻仍然徇情枉法，罔上行私，故意顛倒是非！我就不明白了呢！這些鳥人為什么敢如此膽大妄為？難道是因為兩宮皇太后是女人，皇上年紀又太小，他們才敢如此藐法皇權嗎？所以我王昕認為，現在正是朝廷殺一殺這股歪風邪氣的好時機。如若不然，只怕以后地方官員會更加肆無忌憚的藐視朝廷權威，藐視兩宮皇太后的權威。
很顯然，王昕的話，說到了慈禧和慈安的心坎上了。五年前，自己就忍了。可這些人竟然還得寸進尺。不把中央放在眼里。所以兩宮太后需要借著平反楊乃武案的名義，殺一殺地方大員的威風，給朝廷立威。
七，結果
由于有兩宮太后的旨意，歷時多年的楊乃武案最終有了結果。
楊乃武——無罪釋放。
但是朝廷認為楊乃武不知道避嫌，曾與小白菜確有同室教經、同桌吃飯的行為。所以在釋放他的同時，仍然對他責杖一百，以示懲戒，同時革除他的舉人功名，永不錄用。楊乃武回到老家后，繼承父業，余生以種桑養蠶為生，民國三年因患瘡疽，不治身死。
小白菜——無罪釋放。
但是朝廷認為小白菜確有婚后不守婦道，與楊乃武勾勾搭搭的嫌疑，所以在無罪她釋放的同時，仍然對她責仗八十。而她回到老家后，更為凄慘。婆婆不認她，以致她無家可歸。同時新任縣官還要將她另行發配。她抵死不肯，便只好削發為尼，取名慧定，于民國十八年去世。
劉錫彤——發配黑龍江。
作為冤案的始作俑者，余杭知縣劉錫彤被發配到黑龍江充軍贖罪。但還沒上路，他就病死在老家了。
陳魯——革職。
杭州知府陳魯因查案不實，被革職。另外還有候補知縣鄭錫滜、協助欽差主審的寧波知府邊保誠等官員，也被一并革職。
蒯賀蓀——不追究。
浙江按察使蒯賀蓀因為當時已經病故，所以朝廷沒有追究他的責任。
胡瑞瀾——革職后又起用。
浙江學政胡瑞瀾先是被革職，后來又被朝廷起用，先后擔任過廣東學政、太常寺卿、大理寺卿、副都御史、禮部侍郎、光祿大夫等重要職務。1886年病死。
楊昌浚——革職后又起用。
浙江巡撫楊昌浚先是被革職，但僅一年后就經左宗棠保舉，得到起用。后來，因為助左宗棠收復新疆有功。他歷任甘肅布政使、署理陜甘總督、漕運總督、閩浙總督兼福建巡撫、陜甘總督兼甘肅巡撫、兵部尚書等重要職。臨死前受封太子太保。
這一系列判決結果，很顯然，就是我先打你一巴掌，再賞你一顆糖的策略。兩宮太后作為最終決策者，她們貌似并不想與地方官員徹底翻臉。她們只是借機敲山震虎，并不想為了楊乃武一個區區舉人而得罪地方大員。
畢竟，風雨飄搖的清政府還要這些人維持。