我是薩沙，我來(lái)回答。
日本的制度和明朝是根本性不同的。
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所謂首相制度，不同于總統(tǒng)制度，是一種精英執(zhí)政的民主制度。
在三權(quán)分立的基礎(chǔ)上，立法、行政、司法分別由國(guó)會(huì)、內(nèi)閣、法院行使。
日本民眾選舉出國(guó)會(huì)議員，由此選出選出執(zhí)政黨，首相，再組成內(nèi)閣。
民主制度無(wú)非就是這些套路，所以日本的制度并不算特殊。
日本的立法權(quán)是國(guó)會(huì)議員的，議員則是民眾選舉而來(lái)，所以必須考慮到名義。
同樣道理，內(nèi)閣也是間接選舉的產(chǎn)物，比如考慮到民意。
至于法院是獨(dú)立的機(jī)構(gòu)，只對(duì)公民負(fù)責(zé)。
大體就是這樣。
而大明的制度是標(biāo)準(zhǔn)的封建獨(dú)裁制度，同日本制度沒(méi)有什么聯(lián)系。
相反，大明制度就獨(dú)裁制度來(lái)說(shuō)，卻算是相當(dāng)?shù)牟诲e(cuò)，可以說(shuō)是具有現(xiàn)代獨(dú)裁制度的框架了。
最高權(quán)力掌握在皇帝手中，他有最終決策權(quán)。
而國(guó)家還有個(gè)非常重要的內(nèi)閣，內(nèi)閣有包括首輔在內(nèi)的大臣。
表面上，內(nèi)閣大臣并沒(méi)有實(shí)權(quán)，只有在奏折上寫(xiě)出處理建議的所謂“票擬權(quán)”。
但皇帝往往會(huì)照著“票擬”直接批準(zhǔn)，尤其是相對(duì)不重要的國(guó)家大事。
所以，內(nèi)閣雖沒(méi)有權(quán)力，但如果皇帝懶政或者能力不足，那么實(shí)際上國(guó)家大事就是內(nèi)閣在處理。內(nèi)閣也就等于具有實(shí)權(quán)。
但是，這個(gè)實(shí)權(quán)完全是皇帝賦予的，隨時(shí)可以拿走，所以皇權(quán)不可能動(dòng)搖。
同時(shí)內(nèi)閣和皇帝必然會(huì)有意見(jiàn)分歧，甚至?xí)兄苯拥臎_突。
明朝發(fā)明了特殊的司禮監(jiān)秉筆太監(jiān)制度，作為緩沖。
秉筆太監(jiān)理論上只是皇帝的秘書(shū)，實(shí)際上皇帝將很多不太重要的奏折直接交給他來(lái)處理。
所以，秉筆太監(jiān)如果深受皇帝信任，實(shí)權(quán)就非常大，比內(nèi)閣還要強(qiáng)。
但道理相同，秉筆太監(jiān)只是皇帝的走狗，用于作為和內(nèi)閣的緩沖，隨時(shí)可以換人甚至背黑鍋殺掉。
秉筆太監(jiān)一般起不了風(fēng)浪，比如劉瑾、魏忠賢都是被皇帝秒殺的。
自然，秉筆太監(jiān)的存在是皇帝和內(nèi)閣斗爭(zhēng)的必然產(chǎn)物，以避免雙方直接兵戎相見(jiàn)，導(dǎo)致國(guó)家內(nèi)訌。
內(nèi)閣和皇帝都是決策機(jī)構(gòu)，不是具體執(zhí)行機(jī)構(gòu)。
政務(wù)的具體執(zhí)行，主要由六部去完成。
由此行政和決策分開(kāi)，防止內(nèi)閣有機(jī)會(huì)篡權(quán)國(guó)家實(shí)權(quán)，同時(shí)掌握決策權(quán)和行政大權(quán)。
其實(shí)明朝的制度很復(fù)雜，但簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)就是以上三個(gè)。
明朝這套制度，有自己的優(yōu)越性。
相比后來(lái)滿清的軍機(jī)處制度，皇帝獨(dú)攬大權(quán)，雍正批帖子批到活活累死。
明朝最大的優(yōu)勢(shì)就是，對(duì)于皇帝的才能要求不高。
從某種意義上說(shuō)，明朝內(nèi)閣制度，也是類似于日本內(nèi)閣這種精英治國(guó)。
因?yàn)閮?nèi)閣的大學(xué)士們，均是國(guó)家的精英人物，是龐大官僚機(jī)構(gòu)層層競(jìng)爭(zhēng)的勝利者。
無(wú)論什么職業(yè)，哪怕是掏大糞的，能夠做到頂尖也是人精。
這些大學(xué)士們的能力，總體是很強(qiáng)的（當(dāng)然也有少數(shù)書(shū)呆子）。
這些人來(lái)治國(guó)，總比依靠皇帝要靠譜。因?yàn)榛实凼鞘酪u制度，每代皇帝的能力很難預(yù)料，有的是超人，有的則是普通聰明人，有的則是缺心眼。
靠一個(gè)能力難以估計(jì)的人來(lái)統(tǒng)治國(guó)家，還是內(nèi)閣這種精英制度比較靠譜。
自然，內(nèi)閣制度的主要問(wèn)題就是防止內(nèi)閣權(quán)力過(guò)大，可能威脅到皇權(quán)。
然而，由于決策權(quán)、行政權(quán)、尤其是軍權(quán)的分立，內(nèi)閣篡權(quán)幾乎不可能。
即便是著名的張居正時(shí)代，張位極人臣，獨(dú)攬大權(quán)，仍然沒(méi)有篡國(guó)的能力，只是擠兌的皇帝比較郁悶就是了。
所以，很多人驚訝為什么明朝有皇帝30年不怎么上朝，但國(guó)家還是正常運(yùn)行，就是依靠這套制度了。
其實(shí)，這套制度的發(fā)展版本，今天的世界上也普遍存在，只是換了個(gè)名字而已。