郭靖和黃蓉沒有死，而是得道飛升了。
襄陽大戰中，黃藥師從“二十八星宿大陣”中悟得一絲大道之機，九年后終于引得星力淬體，煉就仙軀，飛升而去。
臨行前，黃藥師將“星辰秘法”傳予黃蓉，黃蓉邀郭靖一起修煉，卻不點破功法的秘密，也隱瞞了最后飛升一步。
直至襄陽失陷之日，郭靖和黃蓉為保襄陽軍民而束手就擒，黃蓉才在蒙軍監牢內向郭靖說出“星辰秘法”的最后一步，最后兩人攜手破空而去。
壹
襄陽大戰中，黃藥師以“二十八星宿大陣”大敗蒙軍。在他自己和郭靖、周伯通等人各自帶領一隊宋軍，將陣法完全展開的那一剎，他忽然感到戰場上的兵器交鳴、廝殺聲等各種聲音突然消失，天地一片靜寂，二十八座星宿在天空出現，還落下無數光點，一一沒入大陣之中。
這種感覺只維持了短短一瞬，便宣告消失，但黃藥師卻確信一定不是幻覺。第三次華山論劍后，黃藥師回到桃花島，閉門不出，潛心研究陣法，希望可以再現當日異象。但此后數年，黃藥師先后以金、木、水、火、土為材料，組成陰陽兩儀、三才、四象、五行、六合、七星、八卦，包括二十八星宿大陣等陣法，都是一無所獲。
行有不得，反求諸己。黃藥師反思過后，認為當日引得天人交感的關鍵，不在于陣，而在于人。佛家有云:一切神通變化，悉自具足。說的就是，人本身就是一座取之不盡的寶庫，所以人可成圣、成仙、成佛，擁有無限可能。
雖然想通了這一點，但黃藥師也不可能重新再聚齊那么多的高手，再現當日情景。不過，這并難不倒黃藥師，經過一番思量，他別辟蹊徑，以氣海內的真氣推演陣法，看哪一種能夠引發天人交感。一開始，他把真氣一分為二，試演陰陽兩儀陣法，接著便是三才、四象、五行等等。
黃藥師發現，以真氣試演兩儀、三才等陣法時，隱隱也有溝通天地的感覺，但并不明顯。接著，他試演王重陽所創的“天罡北斗陣”，終于覺得和遙遠的星空中的北斗七星建立起了一絲聯系，但卻并沒有光點落下。后來，隨著他對真氣演練陣法越來越熟練，終于擺出了當日的二十八星宿大陣。
二十八星宿大陣，其中又包含五行生克變化，玄妙非常。隨著陣法施展，黃藥師終于找到了襄陽大戰時的感覺，且更為清晰。他閉上雙目，卻“看見”天空中二十八宿無突然明亮了數倍，每一宿都有無數光點如流星般落下，全部沒入了自己的身體。
隨著星光入體，黃藥師感覺到自己的肌肉、骨骼和氣血，乃至五臟六腑，都在慢慢增強。如此三個時辰過去，黃藥師撤去陣法，陷入沉思:既然二十八星宿大陣，可以引得星力淬體，那么由三百六十個星辰組成的周天星斗大陣，是不是能讓淬體的過程增快十數倍？
周天星斗大陣，須把自身真氣分為三百六十五道，與上天三百六十五顆主星辰一一對應，艱難無比。饒是黃藥師驚才絕艷，學究天人，也足足用去九九八十一日，才將大陣組成。陣法運轉開來時，果如黃藥師所料，周天星辰都被點亮，紛紛落下星力，幫助黃藥師淬煉身軀，脫胎換骨。
此后，黃藥師日日以真氣運轉周天星斗大陣。四十九日后，他已變成了二十歲左右的模樣，鋼筋鐵骨，神完氣足，氣海內的真氣變得如有實質。至此，黃藥師心中生出一絲明悟，自己的身體已被徹底改造，積蓄也異常雄厚，只要找出飛升之法，便可破空而去。
貳
黃藥師學識淵博，于道家亦有涉獵。他知呂洞賓《敲爻歌》中有言:
內丹成，外丹就，內外相接和諧偶。
結成一塊紫金丸，變化飛騰天地久。
丹入腹，非尋常，陰形剝盡化純陽。
飛升羽化三清客，名遂功成達上蒼。
呂洞賓的意思，是說修道之人要結成內外二丹，金丹入腹，剝盡群陰，化為純陽法身，然后十月氣足，結成元嬰，自可羽化飛升。然而黃藥師以武入道，星力淬體，雖可借鑒金丹、元嬰之法，卻遠沒有那么費時費力。
黃藥師心中有了計較，便再度以真氣運轉周天星斗大陣，引入海量星力，同時，他暗運玄法，漸漸在氣海的中心部位，結成一顆黃豆大小的氣丹。氣丹一成，周天星斗似有了主人一般，星力涌入的速度，一時間增加了百倍千倍，金丹肉眼可見變成了一個胚胎的模樣，接著又變成了一個嬰兒……
這一次結丹、化嬰，只不過用去六個時辰。接著，黃藥師感到虛空中生出一種巨大的吸力，使自己飄飄欲起，心知飛升的時刻很快就到，想起自己還有心愿未了，便強自抑制住飛升的沖動，即刻向襄陽而去。
黃藥師舉步前行，一步就跨過了數里，來到海上。一開始，他踏波而行，數步后，很自然變成了凌空虛渡，只用了一炷香的功夫，就來到了襄陽。郭府庭院之中，黃藥師佇立良久，見女兒黃蓉一直酣睡不醒，于是發出一道神識，飄然而去。
這道神識中，先是說了他創出的以陣法入道的功法，接著是叮囑黃蓉可和郭靖一起修煉，但不要告訴他是什么功法。直到了最后一刻，才告訴郭靖功法的性質和結丹化嬰的方法，否則以郭靖的性子，一開始便會拒絕修煉，如此父女倆便永無相見之日。
叁
黃藥師飛升時，蒙軍已又發動了對襄陽的攻勢，且先取了樊城，截斷長江水道，使襄陽成為一座孤城。郭靖和朱子柳商議，都覺襄陽大勢已去，失陷只是早晚的問題。于是他們啟動了“火種計劃”，意圖保存有生力量，待時機成熟，卷土重來。
此前，郭靖和黃蓉已將楊過送來的玄鐵重劍以及君子、淑女二劍，加以西域精鐵，鑄成了倚天劍和屠龍刀兩把神兵利器，并將《武穆遺書》和《九陰真經》的線索藏于其中。
不久后，“火種計劃”啟動，倚天劍和屠龍刀分別由郭襄和郭破虜帶走。郭襄在西川大山深處，暗中積蓄力量。郭破虜則潛伏中原，整合各地丐幫勢力，耶律齊和郭芙隨后也進入丐幫蟄伏。大小武兄弟，則帶著朱家、武家的后代，在昆侖山建立朱武聯合莊，經營西域。
再說黃蓉，她得到黃藥師神識傳信，悲喜交加。悲的是剛送走兒女，父親又離他們而去；喜的是若依法修煉，不但可以再見父親，還可和郭靖千秋萬世，永不分離。為此，黃蓉按照父親所說，騙得郭靖修煉這門功法。
此后，郭靖和黃蓉軍務之余，便日日勤練黃藥師留下的功法，黃蓉名之為“星辰秘法”。兩人很快便發現了這功法的妙處，郭靖提出讓朱子柳等人一起修煉，黃蓉表示這功法未必沒有瑕疵，不如等他們練成之后，再教給其他人。郭靖心想也是這個道理，便擱下了此事，后來，蒙軍攻勢太急，郭靖也就把此事拋在了腦后。
如此近三年時間過去，郭靖、黃蓉不如黃藥師時間充裕，但時日一久，無數星力淬煉之下，也終于達到了脫胎換骨的效果。兩人不但武功大進，而且又漸漸變成了剛進襄陽時的模樣。由于這等情況實在太過驚世駭俗，兩人不得不施展易容妙術，將自己扮成老年模樣，但他們神完氣足，眼中神光湛然，終騙不過朱子柳這樣的熟人兼高手。
這一夜，郭靖和朱子柳在城頭值守，朱子柳問起郭靖近年來的神奇變化，郭靖推脫不過，只好說這得益于岳父黃藥師的一門秘法，若朱子柳有興趣，自己可傳授于他。朱子柳一聽是東邪家傳武功，連忙表示自己只是好奇，絕無覬覦之心。
數日后，蒙軍大舉攻城，郭靖、黃蓉親自上陣廝殺。兩人此時武功已近乎道法，舉手投足之間，蒙軍便是死傷枕籍。兩人穿過敵陣，來到一處山谷中，兩側山坡突然出現數百手持弓箭的蒙軍，一時箭飛如雨，遮天蔽日般向他們射來。郭靖、黃蓉背靠著背，各自拿起一柄長槍揮舞成圈，將箭支紛紛擋在身外。
趁著敵人換箭的功夫，郭靖俯身抓起一把箭支，用力拋向山坡，登時十幾名蒙軍中箭身亡。其余蒙軍見狀，正想再來一波箭雨，殺死二人為同袍報仇，卻聽得一個軍官發令，說丞相有命，郭靖、黃蓉二人務必活捉，違者軍法處置。蒙軍這才停弓不射，殺入谷中。
郭靖、黃蓉又廝殺了一陣，不放心城內局勢，便各自奪了一匹馬沖回襄陽。到了城門處，郭靖發現蒙軍已開始用巨木撞門，城門眼看就要被撞開，急忙飛身落到城門前，一掌“亢龍有悔”擊向巨木。抬著巨木的二十幾名蒙軍，都感到一陣巨大的力量傳來，紛紛被震飛到三四丈外。巨木則一路飛向蒙軍陣中，撞飛了數十名蒙軍后，才落到了三十多丈外，又砸死了七八名蒙軍。
黃蓉此時也已趕到，與郭靖并肩而立。蒙軍剛為郭靖的神勇所懾，一時間竟不敢再度進攻城門。但郭靖和黃蓉看著漫山遍野、源源不斷的蒙軍，都從對方眼中看出了絕望之感。郭靖沉吟片刻，終于下定決心，自己在城門堅守，讓黃蓉帶著襄陽軍民撤走。郭靖本以為自己要費一番口舌，不想黃蓉聞言后立刻飛身進城，讓他一時竟呆住了。
一個時辰后，黃蓉去而復返，表示要與郭靖同生共死。此時蒙軍中有一將領送來口信，說得丞相之令，若郭靖、黃蓉若愿束手就擒，可放襄陽軍民從容離去。郭靖說，若蒙軍半日不攻城，自己愿意束手就擒。將領表示要回去請命。過了盞茶功夫，那將領再度前來，說丞相已答應停止攻城半日，希望郭大俠言而有信。
半日后，郭靖和黃蓉從容進入蒙軍大帳，兩人雙手雙腳都被戴上數十斤的鐐銬。夜間，黃蓉偷偷以“傳音入密”的功夫，向郭靖說出了“星辰秘法”最后一步，說他們可以憑此脫困。兩人依法修煉，一夜丹成、化嬰，攜手飛升而去。
兩人越飛越高，郭靖本想重回大地，卻已有所不能，不由有些惱怒又有些無奈地說:
蓉兒，你又把我給騙了。