其實這個問題還是很難回答的，因為太平天國雖然是農民起義，太平軍的將領們也不是專業軍人出身，更沒有受過專業訓練，但其中的確有許多人的軍事指揮才能和個人的戰斗力都非常的優秀，不然也不可能將清政府的綠營兵打的不敢正面作戰了。清政府在無奈之下才鼓勵各地興辦團練，希望借助民間的力量來對抗太平軍。
但要從太平軍中選出最厲害的五位將領，還真是不太好選，因為優秀的將領還是比較多的。題主說的這個“最厲害”，不知道指的是哪一方面？是單指個人武力值，還是綜合能力？因為太平軍時期已經不是簡單的冷兵器時代了，一個人的武力也很難在作戰中起到多大的作用。我認為如果要選，還是從其軍事指揮才能和作戰成績來綜合考慮更恰當。
從綜合分析來看，我認為石達開、楊秀清、李秀成、陳玉成、蕭朝貴這五人應該算是綜合實力最強的。當然其他還有賴文光、胡以晃、林鳳祥、李開芳、曾天養等人都是太平軍中不可多得的猛將。另外，我認為，如果從組織能力和個人才能上看，馮云山是太平天國中首屈一指的人才，沒有他的貢獻，就不可能有太平天國的起義，在洪秀全每次遇到挫折退縮后，都是他自己孤身一人在堅持，許多太平軍的骨干力量也都是由馮云山吸納到太平軍中來的。還有后來的洪仁玕也都是非常難得的人才。不過，今天既然是說最厲害的猛將，那我們就說一說前面提到的那五個人吧。
第五名，蕭朝貴，為什么將蕭朝貴放在第五呢，因為他是這五個人中最先犧牲的，還沒有和后來與太平軍真正作戰的湘軍交過手。當然，如果蕭朝貴不犧牲的那么早，也許他將會有更為出色的戰績。蕭朝貴和馮云山的早早犧牲，對太平天國是極大的損失，如果他們不死，也許就不會發生后來的“天京事變”了，因為有他們的牽制，各王之間的力量會顯得相對平衡一些。
蕭朝貴本姓蔣，是廣西武宣縣人，因家境貧寒，早年外出務工，后來到桂平一帶以燒炭為生。1846年，蕭朝貴和好友楊秀清一起在馮云山的勸說下，加入拜上帝會。在金田起義后，洪秀全封蕭朝貴為右弼正軍師、前軍主將。其地位僅次于洪秀全、楊秀清兩人，肩負著軍事指揮的重任。1851年10月25日，在永安封王時，蕭朝貴被封為西王、八千歲。
蕭朝貴是太平天國起義后第一位前軍主將，所以在太平天國早期與清軍的作戰中，基本上都是由他在靠前指揮，甚至是身先士卒的親自參與實戰，也取得了非常不錯的戰績。1851年9月11日，蕭朝貴率領的前軍和馮云山率領的后軍密切配合，向駐扎在平南官村的廣西提督向榮部發起攻擊，向榮所部幾乎全軍覆沒，將領被斃命一二十人。這一次大捷是太平軍金田起義后取得的第一次重大勝利。
1852年（清咸豐二年）4月5日，太平軍從永安突圍北上，蕭朝貴督率太平軍幾千人擔負著防止清軍追襲的重任。清軍廣州副都統烏蘭泰率大軍尾隨追擊，蕭朝貴在馮云山的配合下，殲滅清軍四五千人。清軍長瑞、長壽、董光甲、邵鶴齡四個總兵被擊斃，主將烏蘭泰在作戰中墜崖受傷。隨后，蕭朝貴率部攻陷桂林，接著連克興安，全州后進入湖南。蕭朝貴統帥前軍進入湖南后，“所攻必克”，節節勝利，連克道州、桂陽、安仁、攸縣、醴陵、江華、郴州、永明、永興、茶陵，直抵長沙城下。
1852年9月11日，蕭朝貴親自指揮太平軍圍攻長沙，并且初戰告捷，殲敵700余人。12月，蕭朝貴親臨前線，在南門外妙高峰執旗督戰，指揮炮兵轟擊，不幸被清軍炮彈擊中胸部，因傷勢太重，經搶救無效犧牲，年僅32歲。
蕭朝貴為人“極驍勇、勇悍善斗”。就連清政府的相關記載也說蕭朝貴“驍勇善戰，遇敵當先”。忠王李秀成后來對蕭朝貴的軍事才干概括為八個字:“勇敢剛強，沖鋒第一”，作為蕭朝貴的部將，李秀成應該所言不虛。
第四位，陳玉成，英王陳玉成可以說是太平天國后期支持天國的柱石，為太平天國的二次中興立下了不可磨滅的功勞。單論陳玉成個人的武力值，我認為他幾乎可以排在第一、二位。說實話在太平軍的將帥中，我最欣賞的將領就是陳玉成和石達開，特別是陳玉成幾乎沒有任何負面記載。 陳玉成為人義氣，少年成名，英勇善戰，對天國無限忠誠，在遭遇挫折和洪秀全打壓的情況下，依然對太平天國忠心耿耿。
他少年成名，14歲參加太平軍，練就了有一手好槍法。在這五位中，他和李秀成可以說是從太平軍的基層靠實力拼殺出來的，特別是陳玉成應該是從太平軍的敢死隊中成長起來的，1854年6月，西征軍進取武昌時，久攻不下，陳玉成率五百太平軍敢死隊員，冒死攀爬上城墻，得以攻陷武昌城，陳玉成此戰立下首功。所以說論個人武力值他應該更靠前。
他為人義氣，太平軍中只要有人需要他支援，他都是毫不猶豫。湘軍李續賓在九江曾造成太平軍將領林啟榮的犧牲，陳玉成曾發誓“不殺李續賓，愧對貞天候的英靈！”當年陳玉成從九江回援安慶時，曾對留守九江的林啟榮說：“貞天候大人肯守，小侄一定舍命來救！”可惜沒等陳玉成趕回九江，林啟榮已經戰死。1858年，陳玉成與湘軍李續賓部在三河鎮相遇，陳玉成為報林啟榮之仇，多年來魂牽夢繞，這一次絕不肯放過李續賓。陳玉成親自上陣，對湘軍展開猛攻，在隨后趕來的李秀成的援助下，全殲李續賓部六千余人，李續賓和曾國藩的弟弟曾國華在此戰被太平軍擊斃。從這可以看出陳玉成為人義氣，非常夠朋友。
陳玉成的軍事指揮才能是非常優秀的，他善于尋找敵人的空隙，搞長途奔襲，殺回馬槍，在太平軍中流傳著“十三檢點（指陳玉成）回馬槍”。在太平軍與湘軍的多次大戰中都有陳玉成的功勞，克浦口，大破清軍江北大營、三河大捷、二破江南大營、六和解圍等戰役，陳玉成都是做為主要的指揮者，直接參加了作戰。
但是陳玉成畢竟年輕，缺乏指揮大兵團作戰的經驗，在后來與湘軍展開近兩年之久的安慶保衛戰，在太平軍一度占據優勢的情況下，多次敗于清將多隆阿。在這種情況下，陳玉成又犯了過于自信的錯誤，不聽眾人的勸告，將自己手下4000太平軍留在城外，孤身進入壽州，上了叛徒苗沛霖叛徒的當，被其抓住送給了清軍，最終被凌遲處死。終年26歲。
《清史稿·洪秀全傳》說：“玉成兇狠亞楊秀清，而戰略尤過之”。 陳玉成打仗，都是一馬當先，親自沖鋒在前，是太平天國一員響當當的悍將！曾一度令湘軍聞風喪膽，胡林翼曾說：“賊中精銳，只四眼狗一支耳，他何足慮耶！”意思太平軍中只有陳玉成難以對付，其他人不足懼也。可見陳玉成的勇猛是連敵人都認可的。
第三位，李秀成，忠王李秀成在太平天國后期是主持天國軍事的主將。他在參加太平軍后，是從一名普通士兵逐步成長為太平軍的主要將領的。在1862年以后，可以說是李秀成獨立支撐著太平天國的危局。李秀成的性格是“外柔內剛”，柔是委婉從順，剛是堅強果斷。這在他后期的軍事指揮中可以看得出來，
李秀成是太平天國后期首屈一指的人才，他不但在軍事上有出色的戰績，在太平天國內部的政務處理上也有自己獨到的見解。在天京事變后，李秀成向洪秀全提出改革建議，雖然多次遭到洪秀全的呵斥，但他依然將個人榮辱置之度外，犯顏直諫，痛陳利害。李秀成的建議有四點：一是重用翼王、二是擇才而用、三是改革苛法、四是實行善政。作為一名軍事將領，能夠提出在政治上的改革措施，確實不易，而且他的建議對太平天國都可以說是當務之急。但可惜的是他的建議并沒有被洪秀全接受。
我們再看李秀成在軍事上的成績，他率部攻占常州、無錫、蘇州、嘉興等府的絕大部分州縣，建立蘇福省，為太平天國開辟了新的重要基地。特別值得一提的就是他擊敗外國侵略者的“洋槍隊”的事， 李秀成曾對外國侵略者道：“倘不遵我王化，而轉助逆為惡，相與我師抗敵，則是飛蛾撲火，自取滅亡！”說的還是非常硬氣的。1860年，李秀成決定進軍上海。美國人華爾的洋槍隊進犯青浦，李秀成從蘇州帶領人馬去救青浦，大敗洋槍隊，打傷華爾，洋槍隊的三分之一被擊斃。隨后，太平軍在太倉與洋槍隊作戰，法國海軍提督卜羅德被擊斃于奉賢南橋鎮。在浙江慈溪戰斗中，太平軍打死了“常勝軍”頭子華爾。 李秀成曾說：“那時洋鬼并不敢與我見仗，戰其即敗”。
天京事變后，李秀成擔任后軍主將，三河大捷、六合解圍、二破江南大營等戰役，都有李秀成的身影。在湘軍圍困天京后，也是李秀成在獨自協調各方，對天京進行救援。根據當時太平天國面臨的實際情況，李秀成向洪秀全提出了“京城不能守，曾帥兵困甚嚴，濠深壘固，內少糧草，外救不來，讓城別走“的正確建議，他痛切陳詞，甚至請死于殿前，以求聽從。但被洪秀全斷然拒絕，并對其嚴加斥責。
無奈之下的李秀成多方協調救援部隊，籌措糧草，但已經無法挽救病入膏肓的太平天國。在天京城破后，李秀成保護幼天王出逃，臨行前他帶幼天王回家辭別自己母親。“既為忠臣，難為孝子”，李秀成要盡忠保護幼天王，便不能兼顧母親了。李秀成將自己的戰馬讓給幼天王騎，最終自己被清軍擒獲。
李秀成不同于一般的軍事將領，我認為他是有大智慧的，他不但軍事本領出眾，而且治理地方政務也非常出色，如果他能夠有好的環境和條件，能夠獲得洪秀全的支持，他在軍事和政治上的作為會有更好的發展。李秀成在蘇南時，實行了有利于民生的減免政策，生活得到改善的蘇州人民為了感謝他，建了漢白玉碑一座，上書“民不能忘”四字，來歌頌太平天國，歌頌李秀成。甚至在上世紀五十年代，蘇南當地還流傳著許多歌頌李秀成的民歌。這說明李秀成是深受當地百姓愛戴的。但可惜的是他面對的是洪秀全的不信任，還有各方的掣肘、牽制。最終他的各種合理、正確的建議都無法得到實行。
李秀成最大的詬病的就是他被俘后“變節”之說，但這件事到現在也是頗有爭議的，可信度不高，李秀成的真實用意有可能被曲解。而且曾國藩為突出湘軍戰績和丑化太平軍的考慮，對李秀成的供詞也多有改動、刪減。
對于李秀成的評價，梁啟超在為李鴻章所做的傳中，多次提到李秀成，對李秀成贊賞有加，說他“聰慧明敏，富于謀略，膽氣絕倫。”李鴻章本人在寫給曾國藩的信中，也表示在閱覽完《李秀成自述》后，深為感動，贊譽李秀成是“英雄人物”。我認為，作為李秀成敵對一方的李鴻章，他的評價應該是相當公允的。
第二位，楊秀清，將楊秀清排在第二位，主要是考慮到他的綜合能力。楊秀清參加太平軍后，由于他有較強的組織能力，而且多智善謀，被洪秀全封為軍師，太平軍起義一開始，楊秀清就開始指揮太平軍的軍事行動。在永安封王時，楊秀清被封為東王，并擔任太平軍統帥，正式掌管兵權，成為僅次于洪秀全的第二號人物。
正是在楊秀清的指揮下，太平軍勝利進軍兩湖、三江，并建都天京，為太平軍建立了非常有利的根據地，穩定了太平天國前期一段的大好形勢，可以說楊秀清是太平天國杰出的領袖之一。從太平天國起義，到太平天國初具規模，與楊秀清強有力的領導和正確指揮是分不開的。
在楊秀清執掌太平天國軍務期間，他有著極高的權威，建立了順暢的軍事指揮系統，全軍統一由他調度，也形成了各部協調一致的良好作風。在此期間，太平軍各部作戰時相互配合的非常默契，戰斗力和戰斗士氣都處于最強盛的時期，也是太平軍在戰場上處于絕對優勢的全盛時期。
我們再看天京事變楊秀清被殺后，太平軍的軍事指揮系統就始終再難以回到楊秀清指揮時期那種狀態了，各部之間勾心斗角，互不相幫，各自為政，軍事指揮一直難以調度。而且太平軍各部的軍紀松弛、敗壞，侵害百姓的事情層出不窮，這在楊秀清時代是幾乎不存在的。楊秀清曾頒布了《太平軍條規》，包括“定營規條十要”和“行營規矩”各十條，對太平軍的各項事情都做了具體規定和要求。從這里我們就可以看出，楊秀清的政治才能是非常出眾的，可以說在太平天國是再難以找到他這樣的人才的。就連后來的洪仁玕，也無法做到他對天國事物的那種管理有序的狀態。
之所以將楊秀清列入猛將之列，也源于他的軍事指揮才能。洪仁玕評價楊秀清說：“過去東王在世時，拓土開疆，猶有日辟百里之勢，而今進寸退尺，戰勝攻取，大遜于過去了！” 湘軍內部也曾評價楊秀清說：“于行陣機宜，山川形勢，頗能諳習。雖不讀書，罔知兵法，然皆譎詐機警，逞其毒焰，竟能成燎原之勢。”這也說明楊秀清出色的軍事指揮才能，連湘軍也是認可的。
只是可惜，在太平天國剛剛初見成效，楊秀清就被權力迷失了自我，最終導致自己死于非命。由其引發的“天京事變”也是太平天國由盛轉衰的轉折點。按楊秀清的治軍、治國才干是遠強于洪秀全的，這也是他不甘久居人下的原因。
第一位， 石達開，翼王石達開文武兼備，謀勇出眾，屢建戰功，堪稱太平天國第一流的統帥。石達開的綽號“石敢當”，我們單看這個綽號，就知道他膽識過人的。石達開在14歲的時候，就開始行走江湖，廣交豪杰，頗有俠義之士的感覺。在參加金田起義的時候，石達開是帶著4000人一起參加的。在他被封為左軍主將和“翼王”時，僅僅只有二十歲，也成為太平天國最年輕的統帥。
石達開直接指揮作戰的能力，在太平軍將領中應該是最強的，在危急的時刻，他多次力挽狂瀾，扭轉了太平軍不利的局面。1852年，太平軍在長沙城下陷入清軍反包圍，形勢萬分危急，石達開率部西渡湘江，開辟河西基地，緩解了太平軍的缺糧之危，又多次擊敗進犯之敵，取得“水陸洲大捷”，重挫清軍士氣。他率部為全軍先鋒，奪岳陽，占武漢，自武昌東下金陵，二十八天挺進一千八百里，戰無不勝，攻無不克，令清軍聞風喪膽，稱他為“石敢當”。
楊秀清為了抑制石達開的勢力，曾將其留在天京，讓他遠離軍隊。1854年，在太平軍西征失利的情況下，楊秀清不得不讓石達開前往主持軍務，前線將士得知石達開到來，士氣大振。石達開認為太平軍和湘軍最大差距在于水師，便命人仿照湘軍的船式造艦，加緊操練水師。在湘軍兵鋒直逼九江的危急時刻，在石達開的指揮下，太平軍于1855年初在湖口、九江兩次大敗湘軍，使湘軍水師潰不成軍，曾國藩本人也投水自盡，被部下救起。在石達開的正確指揮下，太平軍西征的軍事行動也進入全盛時期。
天京事變后，在大多數太平天國將士的強烈要求下，洪秀全升石達開為通軍主將，主持天國軍務，但實際上洪秀全經歷天京事變后，已經不再相信任何人，聲明“主是朕做，軍師也是朕做”。同時，他任用其兩個兄長對石達開進行牽制，不久洪秀全又收了石達開的兵權，不讓他離開天京。
在這種情況下，石達開從天京出走，由于他在軍中有極高的威望，聽到他出走的消息，沿江翼殿將士紛紛選擇附從，石達開帶走的太平軍竟達到了全部太平軍的一半以上。這也可以看出他在太平軍中的威望。但這也給太平天國帶來了不可挽回的后果，也是太平天國最終走向失敗的主要原因。
石達開有著出色的軍事指揮才能和超強的戰斗力，但他也有著難以回避的缺點，這就是他性格上的缺陷，個人英雄主義情節嚴重。實際上在他從天京出走后，洪秀全幾次派人向石達開服軟，請求其返回天京理政，但他一意孤行，始終不愿再回天京，不能顧全大局，為太平天國重新振興的大計與洪秀全合作。他采取輾轉突襲的戰術，始終在各地之間來回移動作戰，沒有穩定的根據地，無法取得相應的后勤保障，也沒有友軍的支援。長期的孤軍奮戰，導致部隊士氣低落，許多跟隨他的太平軍也多次分化，也使石達開的力量越來越弱。最終在準備進軍四川時，在大渡河兵敗走入絕境。
有記載說石達開武藝高強，甚至將石達開與宋太祖、岳武穆、張三豐、戚繼光、甘鳳池等人，相提并論為拳術名家，他和武林高手陳邦森比武的故事也廣為流傳。 石達開為人義氣，對手下士兵非常關心，在大渡河兵敗的時候，他為了保全手下將士，不顧眾人勸阻，帶著自己的兒子親自到清營談判，希望“不惜一死，以安全軍”。
至于所謂的“乞降信”一事，據與石達開直接作戰的總兵唐友耕對人所說，石達開信中說“甘愿以一人而自刎，全三軍以投安，最后申明，如駱不允許所請，決不會束手待斃，一定反抗到底。"說明謠傳的石達開乞降一事，根本就是子虛烏有。雖然石達開從天京出走，但是他對外始終打的是太平天國和洪秀全的旗號，他率部四處轉戰，也極大的牽制了清政府和湘軍的力量。緩解了天京的壓力。
李秀成曾評價石達開說：“獨服石王，言其謀略甚深。”陳玉成也曾說：“太平軍將領皆非將才，獨馮云山、石達開差可耳”。石達開曾被認為是“中國歷代農民起義中最完美的形象”，只可惜兵敗大渡河，讓多少人為他感嘆。
其實在排這五個人的順序時候，我是非常糾結的，也曾將他們的順序顛過來倒過去好幾次，覺得將誰排在前邊都不合適。還請朋友們看看怎么排，選五個代表人物具體選誰更合適吧。